Структура института

Научно-исследовательские подразделения

Отдел математического моделирования в области физики атмосферы, океана и охраны окружающей среды

Лаборатория математического моделирования гидротермодинамических процессов в природной среде

Отдел статистического моделирования в физике

Лаборатория вычислительной физики

Лаборатория математических задач химии

Отдел математических задач геофизики

Лаборатория геофизической информатики

Отдел телекоммуникационных систем

Лаборатория обработки изображений

Отдел математического обеспечения высокопроизводительных вычислительных систем

Лаборатория численного анализа и машинной графики

Лаборатория системного моделирования

Отдел вычислительных систем и сетей

Научно-вспомогательные подразделения

Сектор информационного обеспечения 
Редакционно-издательский сектор
Библиотека
Отдел международного сотрудничества
Редакция СибЖВМ
Редакция Bulletin of NCC
ООО "Омега Принт"

Диссертационные советы

Ученый совет

Совет научной молодежи

Производственные подразделения

Электротехнический участок
Ремонтная группа
Транспортный участок

Подразделения аппарата управления и административно-хозяйственного обслуживания

Канцелярия
Бухгалтерия
Планово-экономический отдел
Отдел кадров
Аспирантура
Первая часть
Штаб гражданской обороны
Административно-хозяйственная часть
Служба охраны труда и техники безопасности
Отдел материально-технического снабжения